یکی از نکاتی که مستقیماً بر تعیین روش درمان سینوس موثر است، میزان گسترش عفونت این بیماری است. معمولا درمان خانگی و دارویی اولین روشی است که برای برطرف کردن بیماری های مقعدی مورد استفاده قرار می گیرد و در صورت عدم اثربخشی، از سایر روش های تهاجمی استفاده می شود.

اما در مورد کیست مویی باید گفت که تنها راه درمان قطعی آن استفاده از روش لیزر و جراحی است و مصرف داروهای مسکن و آنتی بیوتیک تنها به کاهش التهاب و عفونت بیماری کمک می کند. استفاده از این روش ها بدون نظر پزشک می تواند باعث تاخیر در اقدامات درمانی موثر و گسترش بیشتر عفونت به بافت اطراف بیماری شود. تنها روشی که توانسته جایگزین جراحی برای درمان این عارضه شود، درمان کیست مویی با لیزر است.
لیزر کیست مویی یک روش کاملا نوین است که به دلیل قیمت بالای دستگاه آن، در هر جایی قابل دسترسی نیست و تنها در کلینیک های تخصصی لیزر می توان از این خدمات استفاده کرد. این درمان بصورت سرپایی و بدون نیاز به بیهوشی توسط دکتر متخصص انجام می شود.
جراحی کیست مویی با لیزر کمتر از نیم ساعت زمان می برد، نیازی بستری شدن قبل و بعد از جراحی نمی باشد و بیمار بلافاصله بعد از لیزر مرخص می شود. همچنین لیزر با انعقاد خون مانع از خونریزی در زمان جراحی می شود و همین امر دقت پزشک را بالا می برد.
اما عمل کیست مویی با بیهوشی و یا همان جراحی سنتی به دو صورت باز و بسته انجام می شود. در روش باز یک یا چند برش روی کیست ایجاد شده و عفونت آن تخلیه می شود. محل برش بعد از جراحی بخیه زده نمی شود و پزشک اجازه می دهد که این محل بصورت خود به خود ترمیم و بسته شود.
بنابراین مراقبت از زخم بعد از عمل و تعویض پانسمان و شستشوی محل، کار بسیار دشوار و حساسی است که نقش مهمی در پیشگیری از عفونت خواهد داشت.
در جراحی کیست به روش بسته که معمولا روند بهبودی در آن سریع تر است، بعد از تخلیه کامل عفونت محل زخم را بطور کامل بخیه می زنند. البته احتمال عفونت در این روش هم وجود خواهد داشت و به همین دلیل مصرف داروهای آنتی بیوتیک توسط پزشک تجویز می شود تا از عفونت و عود مجدد بیماری پیشگیری شود.